If a math teacher has lower expectations for the girls in the class, THEY may not challenge them the same way THEY do their male students.
THEY应该还是指的是 a math teacher. 这里a math teacher是泛指的一类的.
意思是说如果数学老师如果对班级里的女生们的期望更低,他们就不会像挑战男生那样挑战她们.
如果是THEY指的是女生们自己,会使用themselves.如果她生们自己对自己的期望低,自然不会挑战自己去一些期望高的事.