在洪灾之后，被浸泡过的瓶装水不能喝，因为瓶装水的瓶盖与瓶口不属于完全封闭的，一些泥沙或者细菌会通过缝隙渗透到到里面，造成污染。对于一些疑似没有受到污染的矿泉水或者桶装水，一定要水烧开才喝。
在洪灾到来的后期，洪水可能淹没或者破坏水源地以及供水设备，其自来水管道等可能会出现破损、渗漏，其主要表现为致病细菌污染、有毒化学物污染等。