《逆战手游》的故事起源于人们在月球上新发现的一种高密度能量矿物：斯格明石。在斯格明石的能源价值被发掘之后，它的应用对世界格局产生了巨大的影响。人类社会爆发了第五次科技革命，能源不再是稀缺资源。
同期，人类联盟和反派组织康普尼在实验室里发现了它可以对时间产生影响。在贪婪的驱使下，人类在月球建立了多座挖掘基地，这直接导致了月球崩裂……玩家作为能够穿越时间的逆行者，逐渐发现了月陨日事件更深层的成因，面对敌人和未来命定的结局，最终决定逆行而战，与宿命正面对抗。