还有一种消毒方法：超声波消毒，因为这种消毒是通过光学原理通过破坏细胞膜而达到消毒的，而病毒是无细胞膜的，所以此消毒方法对病毒就无效的，只能用于有细胞膜的微生物消毒。玻璃义眼和塑料义眼都可以采用。但对德国玻璃义眼是没有必要用此方法消毒。超声波消毒不能消灭病毒，所以其消毒效果当然没有紫外线消毒效果佳。
玻璃义眼因为材料硬度高，其材料表面光滑致密，平时佩戴者只要及时用可以饮用的温水，很容易清洗掉附着的脏物。一般不需要再用其它东西再清洗。如果佩戴者没有及时清洗义眼片，分泌物干在义眼片表面了，分泌物中的矿物质沉积在义眼表面了（如同茶壶里垢），可采用白醋或者李斯特林漱口水放在清洗水中清洗，具体清洗方法请按德国劳莎玻璃义眼的护理方法操作。
塑料义眼因为材料硬度不够，其材料表面光滑度不够，电子放大镜下清晰可见有许多小坑，病原体等脏物，附着沉积在小坑里，一般用水难以清洗掉，所以需要用接触镜护理液：蛋白清洗液清洗护理，并且需要佩戴半年后机械打磨抛光一次，目的是将义眼片材料表面的小坑打平，来达到去掉病原体等脏物。
玻璃义眼与塑料义眼的消毒方法和护理是不同的，是因为义眼的材料不同。佩戴者应该根据自己佩戴的什么义眼材料，采用对此正确的方法，不能张冠李戴，不能用塑料义眼的护理方法来护理玻璃义眼，需要严格按自己佩戴的义眼产品的说明来护理，才不会出现护理错误，损坏义眼。