2006年农历九月十三的五行缺少金。在五行中，金代表西方方向和秋季，而九月属于秋季，所以九月十三缺少金。五行是古代中国哲学中的重要概念，用于解释宇宙万物的相互关系和变化规律。根据五行的理论，金、木、水、火、土相互制约和相生，它们在时间和空间上的分布也会影响人们的运势和吉凶。因此，人们会根据五行的缺失来进行相应的调整和运用，以求得平衡和顺遂。