不会。etc业务不会扣费。etc系统是收费的，是银行、支付机构、高速等与当地交通部门合作开展的业务。etc卡在收费站不会扣费。etc卡是一种不停车收费系统，是以电子技术为手段，对车辆的行驶路径进行精确计算，并在高速公路上进行收费的新型公路收费系统。