首先，第一个问题，两边故事的时间线应该是不一致的。可能很多人记住人名，马上就发现了，可惜lz记不住，是10话左右看出来的，理由有:
这一幕，老太婆说这个男的注意国际舆论，但实际上以男女主的环境根本不需要关注这个，所以这个时间线应该是大灾难之前。

第二个理由：男主的目的是杀掉和他长的一样的人，目前看来很有可能是时男生的双胞胎。
但根据b超图，时男应该只有一个孩子，所以另一个孩子就很奇怪。lz之前看的时候不知道时男是男的，一直以为男主要杀时男，因为这俩长的像

第三个理由，目前看来，男女主碰到的机器生活的女人基本就可以确定是耳朵奇奇怪怪的女生了，证据在被小孩幻觉控制后闪回的画面里。有电脑屏幕，手术刀，场景。另外，最后的心愿是看看天空，我认为对于一个半辈子生活在封闭环境中，是很合理的愿望。

第二个点。
人可以变成蛭子，还是只有学院里的人才能变成蛭子?我个人原来以为蛭子都是人变得，后来发现可能有问题。如果每个人都有机会，那不可能患病的人那么少。那么基本上就是学院里的人才能变成蛭子。那我们可以把之前出现的蛭子和学院里的人对应一下

首先，这个小女孩应该就是，楼下幻觉的蛭子，技能一样，和耳朵奇怪的女生关系好，符合。

其次，杀死女主的隐身怪，在时男去看小宝宝时是具有隐身的功能的，但我不确定隐身的具体是谁，有可能是时男，也有可能是黑头发，也有可能是后脑特别发达上吊的秃头

至于之前的，属实没看出来。

第三点，关于种猪的孩子，我们猜测的是，只有学院里的孩子才会变成蛭子，那种猪的孩子也能变成蛭子，所以对方两个女性，一定是从学院里出来的，这个应该没问题

第四点关于男主的身份，有两个孩子，一个是出生的，一个是制造的，和种猪的孩子做对比，男主应该是被制造出来的，不然小时候觉醒蛭子的能力应该会杀不少人。

第五点，关于番茄天国，之前看到没有很在意，耳朵很奇怪的女生貌似是种番茄的，联系到时间线，这个地方可能就是之前的学院吧，也许。

最后，老院长提到换脑手术，女主也被换脑了，我觉得女主找的医生可能就是这个家伙。

按照当前的剧情发展，男主出生在大灾难开始，那时男生孩子之后，很可能学院会出问题，比如，死掉的没火化，变成蛭子杀掉不少人，造成蛭子大爆发之类的，有很多问题完全没有解释，比如蛭子怎么变成人的，大肚子机器是怎么来的，这是完全不知道的问题，这部番的剧情应该就是男女主在旅行的过程中不断碰到之前学院里的人，揭开当年学院到底发生什么事的过程，如果都能穿起来，剧情没问题的话，属实能称得上当年的巨人了。

推测基本没有问题，漫画也就比动画多出20话左右内容而已