在科目三考试中，停车不熄火会被扣分。根据《机动车驾驶证申领和使用规定》第三十二条规定，考试时，应按照规定的程序和标准进行考试，考试中出现以下情况之一的，视为不合格：停车动作不规范，不熄火停车等。因此，在科目三考试中，停车不熄火会被视为停车动作不规范，扣相应的停车技能分数。