教育部直属大学有北京大学、中国人民大学、清华大学、北京交通大学、北京化工大学、北京邮电大学、中国农业大学、北京林业大学、北京中医药大学、北京师范大学等76所大学，其中北京市最多，共有24所。教育部直属管理的一批高等学校，是中央部门直属高等学校的重要组成部分，目的是在探索改革上先走一步，在提高教学、科研和社会服务等方面发挥示范作用。