声波电动牙刷刷牙高频冲击，同时驱动水清洗，原理复杂，旋转电动牙刷刷牙一般是机械旋转，在牙齿表面摩擦，原理简单，所以在价格上，旋转电动牙刷会比声波电动牙刷便宜。
由于电动牙刷本质上是由电机驱动的，因此电动牙刷的工作原理是电机驱动刷头振动，刷头振动也称为振动频率。市场上电动牙刷的振动频率一般在2000-40000之间，但不是振动频率越大越好，而是适当的振动率、舒适的刷毛、功能丰富、定价合适，所以电动牙刷是清洁口腔的武器。
与旋转电动牙刷的使用原理大致相同，但声波振动是通过振动从附着的牙龈上振动牙垢、结石等物质，比旋转电动牙刷清洁牙齿间隙等细节，频率快（振动频率可达到每分钟26000-31000次），使牙膏和唾液在口腔内流动，产生大量精致的泡沫，能更有效地清洁牙齿，适合真正清洁牙齿的用户。其高速振动不会刺激牙龈，但也可以按摩到牙龈。