食品工业原料广泛，制品种类繁多，排出废水的水量、水质差异很大。
废水中主要污染物有：
（1）漂浮在废水中固体物质，如菜叶、果皮、碎肉、禽羽等；
（2）悬浮在废水中的物质有油脂、蛋白质、淀粉、胶体物质等；
（3）溶解在废水中的酸、碱、盐、糖类等：
（4）原料夹带的泥砂及其他有机物等；
（5）致病菌毒等。
食品工业废水的特点是有机物质和悬浮物含量高，易腐败，一般无大的毒性。其危害主要是使水体富营养化，以致引起水生动物和鱼类死亡，促使水底沉积的有机物产生臭味，恶化水质，污染环境。
污水处理菌按其功能主要分为以下几类：
1. 甘度硝化细菌：是一种好氧性细菌，包括亚硝酸菌和硝酸菌。生活在有氧的水中或砂层中，在氮循环水质净化过程中扮演着很重要的角色。广泛存在大自然各个角落，空气、江河、大海、土壤都有，生物学中发现的硝化细菌有几千种之多。

2. 反硝化细菌：反硝化细菌是一种能引起反硝化作用的细菌。多为异养、兼性厌氧细菌，如反硝化杆菌、斯氏杆菌、萤气极毛杆菌等。它们在氙气条件下，利用硝酸中的氧，氧化有机物质而获得自身生命活动所需的能量。反硝化细菌广泛分布于土壤、厩肥和污水中。可以将硝态氮转化为氮气而不是氨氮。主要应用于污水处理,如景观水治理,城市河道治理,水产养殖处理等。
3. 甘度硝化反硝化复合菌种：具备硝化和反硝化双重作用的复合菌种，在污水处理环境日益复杂的情况下，单一使用硝化或反硝化菌种越来越难达到菌种平衡，企业对硝化反硝化的配比也难以准确掌握，造成大量菌种浪费或不足，难以达成理想的污水处理效果。复合菌种可根据水质情况自我扩充繁殖，达到菌种平衡，让污水处理更简单、高效。