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NCBI
Taxonomy 生物分类学数据库
Genome Browser基因浏览器
Blat 序列比对
PubMed 生物学医学文献
(Pre-Medline)
BLAST 局部序列比对
EBI
EBI-genome
GWAS 全基因组关联分析,涉及单核苷酸多态性
UniProtKB 蛋白质序列
Swiss-Prot 蛋白质序列
InterPro 蛋白质家族
Clustal Omega 多序列比对
BLOSUM越大越相似
PAM越小越相似
FASTA格式 基于文本用于表示核酸序列或多肽序列
多序列比对方法
Clustal Omega,T-Coffee,MUSCLE
PRRP,DIALIGN
异同源
基于字符 最大简约 最大似然
基于距离 邻接 UPGMA(非加权分组平均) 最小进化
自展法 证明可靠性
MAGA 进化树构建
Fastq文件格式
功能蛋白组学
HPP Human Proteome Project
CHPP B/D HPP
ExPASy 蛋白质酶切位点信号肽亚细胞定位功能域的预测
PIR 蛋白质序列数据库
SCOP 蛋白质结构数据库,描述蛋白质域的家族,超家族,折叠,等级等信息
PDB 蛋白质结构数据库,含原子空间坐标
MMDB (NCBI)蛋白质结构数据库二硫键信息等
SWISS-MODEL 蛋白质空间结构预测
PSI 蛋白定位 Protein Structure Initiative?
RxList 药物数据库
非冗余数据库 NRDB
Refseq


IP属地:浙江1楼2020-05-03 15:35回复