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问题其实都差不多，就不分点回答了……
中间改了的确会产生蝴蝶效应，但是【收束】既然是【收束】，就说明“世界”会强制收束的事情发生，无法更改。即便是有蝴蝶效应，也无法影响到最终的结果。比如本篇中冈部想要拯救真由理，使用了各种方法带着真由理逃跑，然而真由理无论如何都会以不同的方式死去。
你对整个世界线收束的【因果】理解有问题，这就牵涉到你后面的问题“真由理对世界线有很大的影响吗？”答案是没错。不是说这条世界线上必须死一个人（不管死谁都行），而是只能真由理死。
为什么？因为只有真由理死亡，才会导致冈部桶子等人化悲愤为力量，成立瓦尔基里抵抗组织，和sern建立的反乌托邦世界对抗，研发出时间机器。才会有铃羽回到过去，时间机器砸到广播馆顶，助手父亲的会议才会临时取消，助手才会在那个时候不死，遇见冈部，一起做电话微波炉的实验，被rounder发现，才会导致真由理的死亡……
这是一个在α线上完整的因果环，这个环上的任何一个环节都不能被改变，改变了就不是α世界线了。
至于改变结局，是在前后的因果都不发生大幅度变动的情况下，改变你想要改变的一瞬间的事实（比如本篇最后一集中助手的死活），从而使得未来一些本应注定发生的事情发生变动。【欺骗世界】和冈部之前所做的那些普通的改变是有很大区别的。
你后续的问题里我觉得你对“收束”一词的理解也有些问题……什么叫“他改变了他爸成名的契机，世界线又收束了，他爸就会变成普通人”？世界线收束是指一些事情注定发生了，你都能很轻易地改变了为什么还叫收束呢……至于这部分的问题，改变父母结婚首先要看这个人在历史中的重要性，如果他的出生是收束，那么他无论如何也改变不了他父母结婚。比如铃羽的出生，以及她父母桶子和由季的婚姻就是世界线中范围非常广的收束，几乎每条世界线桶子都会和由季生下铃羽。如果他的出生不是收束，那么他这种行为无异于作死，他可能消失，可能发生了很大变化以另一个身份活在世上，总之很难预料。被抹杀的人自然就是消失了……如果他爸爸对世界产生重大影响，他也许可以改变他爸爸成名的契机，但一般情况下他爸爸还会以不同的方式出名，而不是有其他人代替他爸爸成为名人。

就是平行宇宙论，你回到过去若做了产生祖父悖论的事，那么你就回到的是另外一个世界线的宇宙。 第一部玲的时光机第一次回去救红，主角不巧把红捅死了就去的是另外一个世界线宇宙。但第二次回去救红，只是还原了红倒在血泊中（被电晕血是主角故意流的血）的假象而救了红，就有可能是回到跟平行宇宙无关的主剧情世界。