GROMACS是一个功能强大的分子动力学的模拟软件,其在模拟大量分子系统的牛顿运动方面具有极大的优势,同时由于其速度快,在非生物体系统中也得到了广泛的应用,包括玻璃和液晶到聚合物、晶体; AMBER包括一系列用于分子模拟的分子力学力场和分子模拟的软件包,程序很全,大约包含60多个程序,相互协调工作,现在已经发展到版本16,AMBER功能涵盖种类非常多的生物分子,包括蛋白、核算以及药物小分子。
关于“分子动力学模拟技术与应用”专题培训班课程内容
AMBER建模 课程1 Linux基础
课程2 AMBER软件简介
课程3 模型文件的预处理
上机实践
AMBER实例:蛋白-配体复合物的预处理
AMBER计算 课程4 能量优化、分子动力学模拟
上机实践
AMBER实例:能量优化、分子动力学模拟
GROMCS建模 课程5 水溶液中建模
上机实践
GROMACS实例:多肽在水溶液中建模
课程6 磷脂双分子层中建模
上机实践
GROMACS实例:多肽在磷脂双分子层中建模
AMBER数据分析 课程7 结合自由能计算
上机实践
AMBER实例:结合自由能计算
课程8 结合自由能分解
上机实践
AMBER实例:结合自由能分解计算
课程9 分子动力学轨迹分析
上机实践
AMBER实例:分子动力学轨迹分析
课程10 能量优化、分子动力学模拟
上机实践
GROMACS实例:模拟多肽在水溶液中,模拟多肽在磷脂双分子层中
课程11 分子动力学轨迹分析
上机实践
AMBER实例:分子动力学轨迹分析
联系人:康老师 联系方式:18351788667 15311528166 QQ:1608279788
{具体课程内容及安排可联系招生老师或者群文件查看}
关于“分子动力学模拟技术与应用”专题培训班课程内容
AMBER建模 课程1 Linux基础
课程2 AMBER软件简介
课程3 模型文件的预处理
上机实践
AMBER实例:蛋白-配体复合物的预处理
AMBER计算 课程4 能量优化、分子动力学模拟
上机实践
AMBER实例:能量优化、分子动力学模拟
GROMCS建模 课程5 水溶液中建模
上机实践
GROMACS实例:多肽在水溶液中建模
课程6 磷脂双分子层中建模
上机实践
GROMACS实例:多肽在磷脂双分子层中建模
AMBER数据分析 课程7 结合自由能计算
上机实践
AMBER实例:结合自由能计算
课程8 结合自由能分解
上机实践
AMBER实例:结合自由能分解计算
课程9 分子动力学轨迹分析
上机实践
AMBER实例:分子动力学轨迹分析
课程10 能量优化、分子动力学模拟
上机实践
GROMACS实例:模拟多肽在水溶液中,模拟多肽在磷脂双分子层中
课程11 分子动力学轨迹分析
上机实践
AMBER实例:分子动力学轨迹分析
联系人:康老师 联系方式:18351788667 15311528166 QQ:1608279788
{具体课程内容及安排可联系招生老师或者群文件查看}