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求推荐几个找原核生物启动子终止子的软件或者网站

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本人开学大四,现在在跟着生信方向的导师做一些基础的工作,是一个萌新,将来也想上这方面研究生。
我遇到了一些问题,想向大家求助:
首先,这周交给我的任务是分析一个微生物基因簇的结构,给了我这个基因组的序列,我也读了很多这方面的材料,但是找不到能用来分析原核生物终止子的工具。
第二,我用了http://fruitfly.org/seq_tools/promoter.html上的工具来找启动子,但是找出来一大堆,我也不知道怎么分析。
第三,基因簇的结构如果要分析是不是一定要每个基因都单独拿出来,还是几个相近的放在一起或者一股脑全堆进去。
希望大家能够给我解答!谢谢,这些问题我都问过老师和师兄了,他们让我自己思考,但是对于原核生物转录方面我的知识确实比较有限,需要大家的点拨!~


IP属地:广东1楼2016-08-24 10:17回复
    orf finder挺好用


    IP属地:广东来自Android客户端2楼2016-08-24 12:36
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