感觉赛前研究Z神的博士将那些Z神的分散细胞带到会场附近，就是等待阿兰集齐所有的Mega能量帮助他完成他的野心。所以感觉小智可能会输掉比赛使得阿兰收集齐了Mega的能量装置。那个红头发的博士一直是在利用阿兰帮他办事，收集能量的事情一面对阿兰说是为了救小针，其实是为了让他得到能量后为他的研究做贡献，然而就因为这些研究才导致了Z神的诞生，所以才有后面的剧情。
当然这些都是我的猜测，一连串的剧情铺垫，有种很强烈的感觉会是这样的发展情形。