农学院、园艺学院、植物保护学院是2016年由原农学与生物技术学院各系分别独立分离设院建立的。
农学与生物技术学院的前身是始建于清末的京师大学堂农科大学农学门,已经有102年的历史。1949年由北京大学农学院、清华大学农学院、华北大学农学院相关院系合并组建为北京农业大学农艺学系、植物病理学系、昆虫学系和园艺学系,并设置相应的本科专业。1952年,随着全国性的高等学校院系调整,将原来的系和专业调整为农学系(设农学专业)、园艺系(设果树蔬菜、造园2专业)、植物保护系(设植物保护专业)。1958年,学校进行系和专业调整,调整为农学系(设农学专业、农业植物生理及生物化学专业、作物遗传选种及良种繁育专业),园艺系(设果树园林专业、蔬菜栽培专业),植物保护与农业微生物学系(设植物病理专业、农业昆虫专业、农业微生物专业)。
现在的院系设置及本科招生专业为:
农学院:农学、种子科学与工程
园艺学院:园艺、园林
植物保护学院:植物保护
农学院、园艺学院、植物保护学院(原农学与生物技术学院官网)http://nxy.cau.edu.cn/index.html
园艺学院新官网:http://yyxy.cau.edu.cn/yuanyi/;JSESSIONID=1351546f-a6a2-491a-a7b4-f45bd0a3585c