故事发生在未来时代的某城市。 艺术学校的小姑娘然然非常喜欢邻家的小弟弟豆豆，上学放学都带他一起走，一天在地铁里豆豆看着兔子的海报，然然见后也抬眼看海报，转眼豆豆失踪了。 然然带丢了小弟弟，心中万分内疚，她到处寻找豆豆，班里同学也都帮助寻找，还将寻人启事输入电脑网络，但没有一点线索。
与此同时，这个城市突然降临了“不明飞行物”，它有先进的超磁场屏幕掩护，谁也看不见它。宇航局安全处敏感地发现了异常，派去侦察的两个特工莫名其妙地失去了记忆。局长调回寻找豆豆的侦察员叶云，给他看监视录像：从雾霭迷朦中走出一个孩子样的人，很快就消失得无影无踪。 然然的班上来了个转学生，他自称叫李大米，可他长得太像豆豆了，只是多了一副眼镜和长长的头发。
李大米随身带着一个神奇的游戏光盘，如果谁玩光盘的游戏,再喊五遍"疯狂的兔子"，光盘里的兔子就会一跃而出，跳到那人的衣服上，擦也擦不掉，如果脱掉衣服，就会看到兔子已印到皮肤上，洗也洗不掉，上面还有“疯狂的兔子”五个字。李大米热心地让每个人玩，身上印上兔子的同学都变得疯狂了，失去了理智，野蛮凶恶。
一天，轮到然然玩了，然然看到善良的同学变的如此疯狂，她拒绝玩光盘，失去理性的“兔子”们砸坏了她心爱的小提琴。城市里“疯狂的兔子”越来越多，像瘟疫一般。 原来是西伯尔星球的科学家劫走了豆豆改变他的大脑磁晶体，改名为“李大米”，派他到地球来，目的是抹掉人类的良知，以达到占有地球的目的。 科学家们研究“疯狂的兔子”，可苦于找不到破译的密码，为了找到李大米演变的轨迹，需要一个孩子作为试验品模拟。然然挺身而出，为找回小弟弟，为了挽救人类命运，她冒着变成植物人的危险，躺上试验台。