当然据说当年这个方案是为拉丁化汉字做准备的，就算这样拼写也比较长吧？除非为了留着短拼写作同音区分，我猜的对吗？

iong实际上是üng，是ün对应的后鼻音。为了减少ü的使用才这样转写的。
至于jia里的i，是因为j作为辅音并没有i的发音，直接把j发成ji，是对这个字母的一种呼读法，单独发辅音j，不好发音，不利于教学，

【人口一大半的南方人都发平舌音并不会影响交流啊。】
你的这句话就有可能影响交流。
你说的是：是南方人占全国 的人口一大半，还是南方人的人口一大半？
不过，无论你的这句话指的是哪部分人，你的意思我明白。
你就是想说，南方人不会发翘舌音，现在的汉语拼音南方人不适应，用起来困难重重。
对吧？
我要告诉你的是：
当年参与汉语拼音制定的人，基本上都是南方人。
你把这个疑问帖子发在本吧，也说明你知道周老先生是南方人。
制定汉语拼音的人，他们会不会翘舌音？他们知道不知道南方人死活都不会翘舌音？
他们为什么弄了一个南方人自己都不会的拼音方案？
他们就不怕给南方人制造麻烦而被“自己人”质疑甚至是诟病和谩骂么？
如果制定汉语拼音的南方人如周老会翘舌音，你怎么就不会呢？
你所说的“大部分”基本上应该是没有统计数据做基础的，只是你个人的一种臆想。
所以，你对汉语拼音的质疑，
基本上是自己或你周围的少数人为自己的某种语言上的缺憾找借口，
是给找一个自认为是合理的托词而已。