1806年欧仁被拿破仑正式收养，并且欧仁迎娶了巴伐利亚公主奥古斯特.阿米莉亚。尽管拿破仑是利用这次联姻加强与巴伐利亚的联盟，但是欧仁与他的妻子还是非常相爱的。拿破仑还授予欧仁威尼斯亲王的爵位。
欧仁继续对意大利进行统治没有重大事件发生直到1809年奥地利与法国及其盟国开始新的战争时。当奥地利军队入侵意大利时，欧仁被任命为意大利军团总司令，麦克唐纳将军则作为他的助手。那年4月他在萨西莱战役中失败，但是在同年5月他在皮亚伟获胜，并迫使Jellachich投降。在6月他又在拉布战役中获胜。随后他带领军队与拿破仑在奥地利的大军会师，然后他参加了瓦格拉姆战役。欧仁满载荣誉而归。在接下来的几年中，他被授予了匈牙利的圣埃蒂安大十字勋章，瑞典塞拉芬大十字勋章，瑞典之剑大十字勋章，萨克森的皇冠大十字勋章，他成为金羊毛骑士团的骑士。
在1812年的俄国战役中，欧仁带领他的意大利军队加入到大军团。他的部队番号为第四军，他领导部队经历一系列的战役包括奥斯特罗夫诺，维捷布斯克，斯摩棱斯克，博罗季诺，克拉斯内和别列津。当12月拿破仑离开军队返回巴黎稳定政局时，拿破仑让缪拉统领大军。然而缪拉担心他的那不勒斯王国也在一月初离开军队。这时，欧仁站了出来承担了军队的指挥，带领他们回到德意志地区，并且向法国俄敌人反击。
1813年拿破仑重新接管军队的指挥，欧仁奉命指挥第五军和第十一军。在吕岑战役后，他被派回意大利负责指挥意大利和伊利里亚的军队。1814年法国本土受到威胁，欧仁继续坚守意大利并且阻击奥地利军队，并在当年2月的明乔河获胜。当敌人承诺他只要背叛拿破仑就可以做意大利国王，他拒绝了他们的建议，保持了对继父的忠诚。拿破仑退位后，欧仁与奥地利将军贝勒格德签署了《斯基亚里诺-里齐诺停战协议》结束了双方在意大利的敌对状态。随后他将军队指挥权交给格雷尼尔将军，把总督的权力交给皮诺将军。
欧仁随后隐退到巴伐利亚与他的妻子的家族一起生活。1815年拿破仑从厄尔巴岛逃离并建立百日王朝，他要求欧仁回到法国支持他但是欧仁没有离开巴伐利亚，相反他听从他的岳父巴伐利亚国王马克西米利安-约瑟夫的建议，没有参加百日王朝。他把他的后半生都用在尝试帮助那些为拿破仑和他本人效力过而如今却陷入困境的法国士兵们。不幸的是他在42岁时死于脑溢血。

欧仁是正派，忠诚，有荣誉感的人，他的两个女儿分别称为瑞典王后和巴西王后，可惜的是42岁就去世了，要是能活到1830年欧仁也许有利于意大利的统一，欧仁在意大利的政策还是开明的。