生物无尘车间增加了杀菌处理环节，目的是控制生物颗粒对卫生环境和工作人员造成的污染。生物无尘车间设计除了工业洁净室设计的几大参数外，还要采取负压措施，避免生产的产品对环境的影响。生物无尘车间设计中要考虑生物因素的影响，设计中要注意以下参数：
（1）控制生物浓度。洁净室除了要满足非生物浓度的要求，还要对生物浓度进行控制，采取措施控制细菌浮菌量和沉降量。
（2）负压与隔离措施。生物安全洁净室必须保证生产车间处于负压状态，维持室内负压，因为生物颗粒的危害程度较高。此外，设计中还应采取隔离措施，用安全柜或者隔离箱，隔离生物颗粒与操作人员，这时的隔离为二次隔离，为生物颗粒污染增添了一道安全屏障。通过隔离措施将洁净室变为负压区，有效地防止了危险生物颗粒的污染。
（3）换气次数要求。生物洁净室设计的排风危害性大，必须控制排风的出风风速在每秒十三米以上。过滤器要以铝箔为板，以金属做框，且要及时检查，及时更换，目的是为了防止潮湿滋生细菌和腐蚀。
（4）其他要求。生物无尘车间设计时通风管道采用不锈钢材料，保证焊接的顺滑度，严格对生产人员的衣物进行消毒处理，进出生产车间更换衣物，进行淋浴及干燥处理，防止由生产人员将生物病菌带入生产车间。
综上所述，医药厂房洁净室是保证药品生产和质量管理的基础设施，医药厂房洁净室的必须以控制生物颗粒和非生物颗粒为设计、施工和运行的目标。因此，在医药厂房洁净室设计中要严格遵循药品生产质量管理规范和洁净厂房设计规范，选择合理的、满足药品生产要求的空气洁净度级别、换气次数、气流组织形式等设计参数，严格按照要求对医药厂房洁净室进行设计、施工、测评，严格对洁净室的工作人员进行消毒处理。