张树声飞函相商于吴长庆，主要是吴长庆与出事之朝鲜半岛最为径捷，当然还有其他的原因。但张树声与吴长庆的相商是在秘密情况下进行的。
刘厚生《张謇传记》所载：“据张謇告我，是年六月二十四日（8月7日），海军提督丁汝昌至登州，持北洋大臣直隶总督张树声之手函，面交吴长庆。函言日本干涉朝鲜内政，促长庆即日赴津，密商机要。长庆偕謇于第二天乘轮赴津。二十六日，船抵大沽口，树声派员引导，径至某公馆下榻。不久树声与其幕友何嗣焜，微行至该公馆，密商派兵东征，并研究措理李是应及对付日本之方案。晤商凡两次，关防极严，在坐除树声、长庆外，唯何嗣焜及謇二人而已。二十八日黎明，长庆及謇乘轮返登。二十九日抵登州后，长庆即发紧急命令，预备开拔。七月三日即率六营军队，登轮出发矣……张树声与吴长庆会谈，何以如此之秘密？因恐日本人探知消息，于军事不利也。树声曾言，据英领事报告，日本在北京、天津都有间谍，而重要行政机关之官吏、书办、仆役，多有为之耳目者。前吴长庆到津，即赴北洋大臣官署谒见，恐不能秘密云。”
对于选定吴长庆跨海勘乱,当时李鸿章与张树声的意见并不一致。
8月13日，李鸿章在《复张振轩制军》的信中，谓：“此事似应分别办理，先令马（建忠）、丁（汝昌）二君带兵船速往，少作声势，帮同朝鲜君臣弹压缉拿魁首，一面商劝日本员将勿遽动兵，静候缉匪严办……至调派陆军，尤须妥筹，由陆则道路阻长，雨水多滞，转运费艰；由水则兵船装载无多，商船租雇费力。或可号称陆军继至，先声后实，俟眉叔等到彼察看情势，再行禀办。计张虚声则护卫亲兵两营小队可矣。若大举，有战事，唯铭军在后路可调，统将勇疏于谋，似须添派稍有智略如吴殿元辈会同照料，庶冀操纵合宜。盛军为津防主队，人数较多，未宜远出。”可见吴长庆尚不在李鸿章的眼目之中。而张树声于同日上的《奏朝鲜乱党滋事遵旨派兵保护折》中则认为：“吴长庆纪律严明，夙谙权略，当能随机应变，从仰副圣主字小御远之至意。至朝鲜事局多艰，靖乱扶危，尤在乘时审势，取决当几。吴长庆到朝后，凡紧要机宜，应请由该提督相度筹办，仍一面咨商臣处，随时奏陈，以应事机而纾宵旰。”
最后，清廷同意张树声奏折所请，确定了吴长庆率兵赴朝定乱。
智擒乱魁
由于壬午兵变使朝鲜受到日本的威胁，涉及到清朝对朝鲜的宗主权，所以吴长庆特别积极，认为这是报效朝廷的好时机。
吴长庆于8月17日亲率庆军，与丁汝昌一道，率2营4哨于登州开拔。吴长庆以3哨与丁汝昌同坐威远军舰，以2营1哨分坐招商局镇东、日新、拱北3船，并以泰安军舰装载粮械军火，计2000余人。后续部队也相继开拔，计6营兵力共3000多人。其时，吴长庆幕府中有：张謇、袁世凯、吴兆有、张光前、周家禄等一批年轻有为的少壮派人物。
8月20日辰刻，吴长庆率部抵达朝鲜。因仁川驻日本军舰、兵船7艘，陆兵1营，吴长庆遂下令所部泊船于相距六七十里之南阳登岸扎营。又令道员马建忠与派充向导的朝鲜陪臣金允植、鱼允中密切侦察。日本驻朝公使花房义质于8月16日带兵进入汉城，开列多款条件，要挟朝鲜。该国王李熙及李是应均未予接见，花房义质也未有翻脸之举。朝鲜国人见吴长庆大军入境，无不欢呼雀跃。南阳府备船十多只，在海口听候调遣。前充议约大副官赵宁夏、金宏集尚幸存，经国王派遣至南阳料理军前各事。吴长庆与马建忠商议，21日由马建忠先驰赴汉城，相机办理。派副将张光前充队从往。吴长庆部署停当，也随即亲率大队进发汉城。留丁汝昌驻海口，以顾后路。
8月23日，日使以朝鲜政府越期不答复其要求，离开了汉城赴仁川，“意存决裂”。整个汉城，人心惶惶。
吴长庆率军队于8月25日到朝鲜京城之后，大营在距汉城7里的屯子山驻扎。布置停当后，吴长庆仅率亲兵1营入城。丁汝昌也将后路部署妥贴，率水师百余人前来汉城。马建忠、丁汝昌乘夜至吴长庆大营，密定机宜。8月26日巳刻，吴长庆轻车简从亲访大院君李是应，稍与寒暄，也就离开了。中午以后，李是应至吴长庆军中行礼节性回访。丁汝昌、马建忠皆先集城外，吴长庆认为时机已到，因马建忠精通英法诸文，且谙于外交，遂令马建忠与李是应笔谈，将李是应拖延至日暮。吴长庆、丁汝昌悉将李是应所带卫队数十人，调往别处。笔谈至暮，李是应似有怀疑，吴长庆突然向马建忠使了个眼色，马建忠知其意，责问李是应道：“君知朝鲜国王为皇帝册封乎？”李是应答道：“知之。”马建忠又厉声说：“王为皇帝册封，则一切政令当自王出，君六月九日之变，擅窃大柄，诛杀异己，引用私人，使皇帝册封之王，退而守府，欺王实轻皇帝也，罪当无赦。”吴长庆遂和丁汝昌起而出帐，迫令李是应乘上了丁汝昌早已为之预备好的肩舆，由丁汝昌率百余名精壮士兵护卫，星夜冒雨急行押送至南阳港海口，随即上登州兵船，由该船管驾官叶伯押解至天津。
吴长庆诱捕了大院君，智擒乱魁，为迅速平定壬午兵变抢占了先机。
平乱迎妃
大院君李是应被押解到天津后，其乱党之聚居于枉寻里、利泰村者就有数千人。这些人世隶兵籍，跋扈难制，与李是应勾结一气，屡次变乱。这时，李是应虽然被扣于天津，而其长子李载冕以大将身份，刚刚把握兵柄，仍然可能作乱。于是，吴长庆于8月28日傍晚，先将李载冕诱拘于南别宫，以北洋水师数十人守之。是夜，吴长庆调派副将张光前、何乘鳌，总兵吴兆有，率领亲兵庆字3营，前捕枉寻里乱党，穷搜居所，短兵巷战，直到天明，生擒150多人，其余悉由屋后逃窜。吴部仅负伤2人。吴长庆亲往搜捕利泰村乱党。由于此地接近中国兵营，乱党已早闻风声，逃之夭夭，仅捕获20余人，两处共捕获170余人。张謇见这些乱党父子、兄弟相依，似愿共命，心大不忍，又以语言不通，急忙向吴长庆建议，请朝鲜国王派捕盗官及司法判书来军中，讯别首犯和从犯，区别对待。当经讯明，正法魁首10人，余皆交朝鲜酌予释放，使他们悔过自新。而李是应之子李载冕自知负罪，不安于位，也于是日请释兵柄。此次乱党也就基本肃清了。